施用种肥的合理方法是在云南农用禽畜撒粪机直销上装设施肥装置，在播种的同时施用种肥。目前，国外发达国家的大多数配备有云南农用禽畜撒粪机直销装置，例如：美国约有45%的谷物条播机、60%的玉米播种机带有施肥装置。我国有十亿亩耕地缺磷，普遍需要施用种肥，但现有的播种机尚不能满足这个要求。用于种子肥料混施的机器是将化肥与种子排入同一输种管中，施于同一开沟器所开的沟底。种、肥混施容易使化肥“烧伤”种子。液肥有化学液肥和有机液肥之分。化学液肥对金属有强烈的腐蚀作用，且易挥发。因此，除某些液肥可采用喷雾方法施于作物茎、叶上外，多数需施入土中，防止挥发、损失肥效和灼伤作物。

在过去传统农业耕作中，禽畜粪便作为一种有机肥是广受农民欢迎的，可是，近几十年来，由于化肥工业的兴起导致以禽畜粪便为原料的有机肥却遭到无情的抛弃。最近几年，随着国家对环境以及对有机肥的重视。畜禽粪又重新回到了农业市场。云南农用禽畜撒粪机直销中的畜禽粪污其实是重要的资源，是利用的问题。培肥地力，发展有机农业离不开有机肥，充分利用其制作有机肥还田，沼气发电等都可以以云南农用禽畜撒粪机直销中的畜禽粪污为原料，而且这些都完全契合我国农业绿色发展的要求和发展方向。有机肥是养殖行业禽畜粪便有机还田，是绿色环保农牧业，是种养结合有机循环，是实现有机健康的保障。

国家对云南农用禽畜撒粪机直销中的有机肥的生产十分重视，近几年在政策方面给予倾斜来支持其发展。从2008年6月1日开始，根据财政部和国家税务总局的文件要求，生物有机肥产品完全免税。山东省政府也已经连续几年针对云南农用禽畜撒粪机直销中的有机肥项目进行了补贴。不仅如此，国家还相继启动“无公害食品行动计划”、“绿色食品”、“有机食品”认证等相关计划及政策，对农产品进行质量控制，一定程度上也带动了有机肥的市场需求。2000-2010年的10年间，中国有机肥料销售年均增速达到56.72%，销售收入由2000年的3.55亿元增长至2010年的317.63亿元，增长了近100倍。

在土壤或植物上施加肥料，可以改善植物生长所需的营养条件，提高有机质和无机质养分的含量。几个世纪以来，中国在世界上是有机物、家畜粪肥、人粪尿、作物残茬堆肥再循环利用好的国家。然而，当农民见到使用化肥的明显效果后就开始大量施用化肥，而忽视了云南农用禽畜撒粪机直销中的有机肥的补充，造成化肥使用过量，不仅污染了环境，也对弄作业造成了损害。我国云南农用禽畜撒粪机直销中的有机肥资源丰富，虽然在数量上保持着持续增长的态势，但在质量方面却有所下降，利用率也在逐年降低。传统的农家肥机制在施用过程中不仅劳动强度大、费时费力，而且工作环境很差，不符合当前农业省工的需求。

云南农用禽畜撒粪机直销中的有机肥料亦称“农家肥料”。凡以有机物质(含有碳元素的化合物) 作为肥料的均称为有机肥料。包括人粪尿、厩肥、堆肥、绿肥、饼肥、沼气肥等。具有种类多、来源广、肥效较长等特点。云南农用禽畜撒粪机直销中的有机肥料所含的营养元素多呈有机状态，作物难以直接利用，经微生物作用，缓慢释放出多种营养元素，将养分供给作物。施用有机肥料能改善土壤结构，协调土壤中的水、肥、气、热，提高土壤肥力和土地生产力。有机肥料是指由动物的排泄物或动植物残体等富含有机质的副产品资源为主要原料，经发酵腐熟后而成的肥料。有机肥有改良土壤、培肥地力、提高土壤养分活力、净化土壤生态环境、保障蔬菜高产等特点，是设施蔬菜栽培不可替代的肥料。设施蔬菜栽培常用的有机肥料主要有商品有机肥料和农家肥。